Расшифровка растительного сырья препаратов традиционной китайской медицины с помощью мультимедиа.

Блог

ДомДом / Блог / Расшифровка растительного сырья препаратов традиционной китайской медицины с помощью мультимедиа.

Jun 05, 2023

Расшифровка растительного сырья препаратов традиционной китайской медицины с помощью мультимедиа.

Scientific Reports Volume 12, Номер статьи: 5988 (2022) Цитировать эту статью 2551 Доступов 8 Цитирований 2 Подробности об альтернативных метриках В связи с быстрым развитием технологии высокопроизводительного секвенирования,

Научные отчеты, том 12, Номер статьи: 5988 (2022) Цитировать эту статью

2551 Доступов

8 цитат

2 Альтметрика

Подробности о метриках

С быстрым развитием технологии высокопроизводительного секвенирования также продвинулись подходы к оценке биологических ингредиентов в препаратах традиционной китайской медицины (ТКМ). Используя подход секвенирования нескольких штрих-кодов, теоретически все биологические ингредиенты можно идентифицировать из препаратов традиционной китайской медицины, если присутствует их ДНК. Биологические ингредиенты нескольких классических препаратов традиционной китайской медицины были успешно проанализированы на основе этого подхода в предыдущих исследованиях. Однако универсальность, чувствительность и надежность этого подхода к разнообразным препаратам традиционной китайской медицины остаются неясными. В этом исследовании мы выбрали четыре репрезентативных препарата традиционной китайской медицины, а именно Бажен Иму Ван, Да Хуолуо Ван, Нюхуан Цзянъя Ван и Ю Гуй Ван, для конкретной оценки подхода к секвенированию нескольких штрих-кодов. На основании биомаркеров ITS2 и trnL мы успешно обнаружили предписанные растительные материалы (PHM) в этих репрезентативных препаратах традиционной китайской медицины (минимальная чувствительность: 77,8%, максимальная чувствительность: 100%). Результаты, основанные на ITS2, также показали более высокую надежность, чем trnL, на видовом уровне, в то время как их комбинация может обеспечить более высокую чувствительность и надежность. Подход к секвенированию нескольких штрих-кодов показал хорошую универсальность, чувствительность и надежность при расшифровке этих четырех репрезентативных препаратов традиционной китайской медицины. В эпоху больших данных OMICS эта работа, несомненно, сделала еще один шаг вперед в применении подхода секвенирования нескольких штрих-кодов при анализе PHM при приготовлении TCM, в направлении лучшей оцифровки и модернизации контроля качества лекарств.

Препараты традиционной китайской медицины (ТКМ) используются в клиниках Китая уже не менее 3000 лет1,2. Его использовали для профилактики и лечения различных заболеваний в Китае, а за последние десятилетия он стал более популярным во всем мире. Препарат ТКМ состоит из множества растений, материалов животного происхождения и/или минеральных веществ. Согласно теории китайской медицины и Китайской фармакопее (КФ)3, различные лекарственные материалы измельчали ​​в порошок или кипятили, затем смешивали и формовали таблетки вместе с медом или водой, чтобы получить препарат традиционной китайской медицины (также называемый запатентованным лекарством). Хотя препараты традиционной китайской медицины широко используются в последние годы, многие проблемы еще предстоит решить, например, контроль качества (КК), при котором особое внимание следует уделять материалам и процессу производства, чтобы гарантировать их безопасность и эффективность. Оценка качества традиционной китайской медицины в основном включает качественный и количественный анализ химических ингредиентов и биологических ингредиентов4. Современные методы контроля качества препаратов ТКМ в основном оцениваются на основе химического профиля4 (например, тонкослойная хроматография (ТСХ)5, высокоэффективная жидкостная ультрафиолетовая хроматография (ВЭЖХ–УФ)6, высокоэффективная жидкостная хроматография-масс-спектрометрия (ВЭЖХ–МС). )7). По сравнению с эталонными растительными материалами или целевыми соединениями, методы ТСХ и ВЭЖХ могут получить информацию о видах, но они недостаточно точны, особенно для идентификации гибридных видов генетики, что может привести к неправильной идентификации и привести к биологическому загрязнению и фальсификации растительного сырья. процесс сбора и изготовления. Однако использование ДНК, фрагмента, который стабильно существует во всех тканях8, может точно идентифицировать растительные материалы на уровне вида, обеспечивая более высокий уровень чувствительности и надежности и, таким образом, дополняя недостатки химического анализа9,10.

Концепция анализа биологических ингредиентов на основе штрих-кодов ДНК была предложена Хебертом11. Чен и др. впервые применили несколько потенциальных штрих-кодов ДНК для идентификации лекарственных растений и их близкородственных видов12. Коглан и др. впервые использовали штрих-коды ДНК, чтобы определить, содержат ли препараты традиционной китайской медицины производные находящихся под угрозой исчезновения видов растений и животных, торговля которыми ограничена2. В 2014 году Ченг и др. впервые сообщили об анализе биологических ингредиентов Лювэй Дихуан Вана (LDW) с использованием метагеномного метода на основе биомаркеров ITS2 и trnL13. После этого появились сообщения о травах препаратов традиционной китайской медицины на основе биомаркеров ДНК, таких как Yimu Wan (YMW)14, Longdan Xiegan Wan (LXW)15 и Jiuwei Qianghuo Wan (JQW)16. Интересно, что в недавних исследованиях сообщалось о нескольких препаратах традиционной китайской медицины, которые могут быть эффективны в профилактике и лечении COVID-1917,18, таких как капсулы Lianhua Qingwen19, гранулы Jinhua Qinggan19, растительный состав Yiqi Qingjie20 и т. д. Благодаря технологии штрих-кода ДНК это Сообщалось, что капсула Lianhua Qingwen может быть эффективной в профилактике или лечении COVID-19, что может быть связано с ее биологическими ингредиентами, такими как Glycyrrhizae Radix Et Rhizoma и Rhei Radix Et Rhizome3. Тот же принцип применим к гранулам Jinhua Qinggan и растительным соединениям Yiqi Qingjie. Эти результаты еще раз подчеркнули важность анализа биологических ингредиентов препаратов традиционной китайской медицины с использованием метода штрих-кода ДНК.

 510 bp and the reads of trnL whose length is < 75 bp were removed. After that, we discarded the sequence whose average quality score was below 20 in every five bp sliding window along with the whole reads. The sequences that contained ambiguous base call (N), homopolymers over eight bases or primers mismatched, incorrect barcodes, were also removed from ITS2 and trnL datasets./p>