Сетевая фармакология иридоидных гликозидов Eucommia ulmoides Oliver против остеопороза

Блог

ДомДом / Блог / Сетевая фармакология иридоидных гликозидов Eucommia ulmoides Oliver против остеопороза

Jul 05, 2023

Сетевая фармакология иридоидных гликозидов Eucommia ulmoides Oliver против остеопороза

Scientific Reports, том 12, номер статьи: 7430 (2022) Цитировать эту статью 2105 Доступов 4 Цитирования Подробности о показателях Eucommia ulmoides Oliver — одно из широко используемых традиционных китайских лекарств.

Научные отчеты, том 12, Номер статьи: 7430 (2022) Цитировать эту статью

2105 Доступов

4 цитаты

Подробности о метриках

Eucommia ulmoides Oliver — одно из широко используемых традиционных китайских лекарств для лечения остеопороза, а иридоидные гликозиды считаются его активными ингредиентами против остеопороза. Целью данного исследования является выяснение химических компонентов и молекулярного механизма иридоидных гликозидов Eucommia ulmoides Oliver при лечении остеопороза путем интеграции сетевой фармакологии и молекулярного моделирования. Активные иридоидные гликозиды и их потенциальные мишени были получены из текстового анализа, а также из баз данных Swiss Target Prediction, TargetNet и STITCH. В то же время для поиска мишеней, связанных с остеопорозом, использовались DisGeNET, GeneCards и база данных терапевтических мишеней. Сеть белок-белковых взаимодействий была построена для анализа взаимодействий между мишенями. Затем ресурсы биоинформатики DAVID и проект R 3.6.3 были использованы для проведения анализа обогащения онтологии генов и анализа путей Киотской энциклопедии генов и геномов. Кроме того, взаимодействия между активными соединениями и потенциальными мишенями были исследованы посредством молекулярного стыковки, молекулярно-динамического моделирования и анализа свободной энергии связи. Результаты показали, что в общей сложности 12 иридоидных гликозидов были идентифицированы как активные иридоидные гликозиды Eucommia ulmoides Oliver при лечении остеопороза. Среди них основными соединениями были аукубин, рептозид, генипозид и аюгозид. Анализ обогащения показал, что иридоидные гликозиды Eucommia ulmoides Oliver предотвращают остеопороз главным образом через сигнальный путь PI3K-Akt, сигнальный путь MAPK и сигнальный путь эстрогена. Результаты молекулярного докинга показали, что 12 иридоидных гликозидов обладают хорошей способностью связываться с 25 белками-концентраторами-мишенями, которые играют решающую роль в лечении остеопороза. Результаты молекулярной динамики и молекулярной механики по площади поверхности Пуассона-Больцмана показали, что эти соединения продемонстрировали стабильное связывание с активными центрами целевых белков во время моделирования. В заключение, наше исследование показало, что иридоидные гликозиды Eucommia ulmoides Oliver при лечении остеопороза включают многокомпонентный, многоцелевой и многопутевой механизм, что дало новые предложения и теоретическую поддержку для лечения остеопороза.

Остеопороз (ОП) – это хроническая эпидемия, характеризующаяся низкой костной массой и ухудшением микроархитектоники кости, что приводит к повышению хрупкости костей и риску переломов, а также накладывает тяжелое экономическое бремя на общество1. Этиология ОП очень сложна и включает взаимодействие эндокринных, нутритивного статуса, генетических, физиологических и иммунных факторов2,3. Дисбаланс между костеобразованием остеобластов и костной резорбцией остеокластов является основной причиной OP4. Лечение ОП зависит от лекарственной терапии, включающей бисфосфонат, селективный модулятор эстрогеновых рецепторов, смешанный агонист стероидных рецепторов, моноклональные антитела против RANKL, аналог паратгормона и т. д.5. Эти препараты могут облегчить потерю костной массы и в определенной степени улучшить клинические симптомы, но их долгосрочное клиническое применение ограничено низкой переносимостью, тяжелыми побочными эффектами и высокой стоимостью6. Поэтому большое значение имеет разработка более безопасных, эффективных и экономичных препаратов для лечения ОП.

Традиционная китайская медицина (ТКМ) имеет долгую историю в Китае. Он становится все более популярным благодаря преимуществам хорошего лечебного эффекта, небольшого количества побочных эффектов и доступной цены7. В теоретической системе традиционной китайской медицины ОП признается синдромом костной атрофии или артралгии, вызванным почечной недостаточностью8. Eucommia ulmoides Oliver (ЕС) является одним из наиболее важных питательных лекарственных веществ в традиционной китайской медицине. Было обнаружено, что ЕС может эффективно предотвращать потерю костной массы, улучшать биомеханическую прочность костей, предотвращать ухудшение микроархитектуры трабекулярной кости и излечивать OP9,10,11. Современные исследования считают, что иридоидные гликозиды являются основными фармакологическими ингредиентами ЕС12,13,14. Существует множество исследований, показывающих, что иридоидные гликозиды играют основную роль в резорбции и ремоделировании кости. Иридоидные гликозиды могут повышать дифференцировку и активность остеобластов, способствовать формированию кости, ингибировать образование остеокластов, снижать активность остеокластов и ограничивать резорбцию кости15. Такие, как аукубин, могут улучшить дифференцировку остеобластов в клетках MG6316. Генипозид может индуцировать пролиферацию и дифференцировку клеток MC3T3-E117. Каталпол может подавлять остеокластогенез и ослаблять резорбцию кости, происходящую из остеокластов18. Асперулозид может ингибировать дифференцировку остеокластов и уменьшать количество остеокластов19. Монотропеин может способствовать образованию остеобластов и снижать выработку провоспалительных цитокинов в остеобластах20. Свертиамарин может значительно повысить уровень экспрессии OPG и снизить активность остеокластов21. Эти результаты показали, что иридоидные гликозиды обладают потенциальным профилактическим и терапевтическим действием на ОП. Однако исследований химических компонентов и молекулярных механизмов действия иридоидных гликозидов Eucommia ulmoides Oliver (IGEUs) при лечении ОП мало.

 0.4”, disconnected nodes in the network were hidden, and other parameters remained the default settings. Cytoscape 3.8.0 was used to construct and visualize the PPI network47. At the same time, we analyzed the PPI network using the plug-in of “Analyze Network” tool. Network topology analysis, which contains many topological parameters, was applied to network pharmacology, among which edgecount is the most important parameter48. The edgecount of a node refers to the number of other nodes that interact with it49. We selected the nodes with more than twice the median edgecount of all nodes to construct the hub PPI. The correlated targets in hub PPI were identified as the hub targets./p> 4.0 indicates certain binding activity, Total Score > 5.0 indicates good binding activity, while Total Score > 7.0 indicates strong binding activity56. PyMOL 2.4 (https://pymol.org) software was used to visualize the docking results57./p> 5.0 kJ/mol or < − 5.0 kJ/mol were considered to be the critical residues for ligand binding to protein65. The calculation results showed that Trp352 and Tyr335 in AKT1 had strong interactions with reptoside (Fig. 9A). Aucubin had the lowest interaction energy with Leu346. In addition, the binding energy of aucubin with Leu387, His524 and Leu525 were also low (Fig. 9B). The binding of geniposide to MAPK1 was mainly supported by the amino acids’ residues Leu156, Val39, Ile31, Lys54 and Asp111 (Fig. 9C). Analysis of MAPK3-ajugoside complex showed that Leu346, Leu387, His524, Leu525 and Glu353 energetically favor the binding of ajugoside (Fig. 9D). Overall, the identification of critical residues in these proteins facilitated the discovery of new selective inhibitors against OP-related targets./p>